Доктора Мобиуса и группу ученых Nod похитили и под страхом смерти заставляли помогать в осуществлении различных экспериментов для Братства. Чтобы их вызволить, GDI решила отправить элитного коммандоса, Ника Паркера - собственно в его шкуре нам и придется пробегать всю игру - который славился тем, что всегда выполнял поставленную задачу, хотя и в не совсем обычной манере. Сюжет линеен, то есть путешествовать по миру Command & Conquer нам придется исключительно по заданному разработчиками маршруту – никаких отступлений от плана. Вся игра же состоит из двенадцати достаточно больших по объему уровней, которые, скажу вам честно, не так уж легко и пройти. По мере прохождения нам будут попадаться всяческое оружие, начиная от полуавтоматического пистолета и заканчивая маяком ионной пушки, транспортные средства, ассортимент которых никак не уступает количеству оружия – легкие пустынные багги, средние танки, или тяжелейшие мамонты – на всем этом нам придется прокатиться, и, конечно, топы врагов и союзников.